2006年3月20日，亳州市中级法院作出一审判决，认定杨茂军犯故意杀人罪，判处其死刑，剥夺政治权利终身。杨茂军不服提出上诉后，4月25日，安徽省高级法院以“部分事实不清，证据不足”为由，裁定撤销原判，发回重审。8月29日，亳州市中级法院第二次开庭审理此案，维持一审原判，杨茂军仍然不服提出上诉。11月20日，安徽省高级法院裁定驳回上诉，维持原判，并依法核准杨茂军死刑。就在亳州市中级法院送达裁定书时，杨茂军提出要检举他人犯罪。12月31日，亳州市中级法院以“罪犯杨茂军检举他人犯罪”为由，书面报请对杨茂军暂缓执行死刑。2007年1月10日，安徽省高级法院批复同意。
此后，该案一直久押不决，安徽省检察院有关部门多次进行督办和监督。2011年3月7日，安徽省高级法院决定对本案进行再审，并裁定撤销原一、二审裁判，发回重审。8月26日，亳州市中级法院作出一审判决，第三次以故意杀人罪判处杨茂军死刑，剥夺政治权利终身。
杨茂军在法定期限内提出上诉。案件进入二审程序后，安徽省检察院立刻派人依法从速办理。
案件承办人通过认真审查全案证据、诉讼材料并进行调查后认为，杨茂军虽然在供述上有反复，但从口供变动轨迹以及案件证据情况来看，可以认定其实施了故意杀人行为;杨茂军虽然一再检举他人参与作案，但从查证情况以及常理和逻辑上分析，杨茂军实为借谎言企图减轻罪责，免除一死。2011年11月23日，安徽省高级法院开庭审理此案，出庭检察员发表出庭意见认为，本案主要犯罪事实清楚，证据确实、充分，建议合议庭驳回上诉、维持原死刑判决。12月28日，安徽省高级法院就此案进行宣判，采纳检察机关意见，裁定驳回杨茂军上诉，维持原判。
